L’Osservatorio Epidemiologico collabora con il Network Regioni dell’Istituto di Management Scuola Superiore Sant’Anna – Università di Pisa che ha sviluppato il Sistema di Valutazione delle Performance dei Sistemi Sanitari Regionali che risponde all'obiettivo di fornire una modalità di misurazione, confronto e rappresentazione del livello della propria offerta sanitaria.

Un processo di condivisione inter-regionale ha portato alla selezione di circa 450 indicatori, di cui circa 170 di valutazione, volti a descrivere e confrontare, tramite un processo di benchmarking, le diverse dimensioni della performance del sistema sanitario: lo stato di salute della popolazione, la capacità di perseguire le strategie regionali, la valutazione della dinamica economico-finanziaria e dell'efficienza operativa, la valutazione dell'esperienza degli utenti e dei dipendenti, l'ambito dell'Emergenza-Urgenza, la prevenzione collettiva, il governo e la qualità dell'offerta, l'assistenza farmaceutica. I risultati sono rappresentati tramite uno schema a bersaglio, che offre un intuitivo quadro di sintesi della performance ottenuta dalla Regione, illustrandone immediatamente punti di forza e punti di debolezza. Dal 2008, viene annualmente redatto un report, con i risultati delle Regioni e delle Aziende. Dal 2010, il report viene reso pubblico e accessibile da parte tutti gli stakeholder. Le Regioni aderenti al network considerano un valore la trasparenza e l'accountability del proprio operato e rendono pubblici i propri risultati. Dal 2017, al bersaglio viene affiancata una rappresentazione tramite "pentagrammi", per mostrare l'efficacia dei sistemi sanitari regionali nella presa in carico dei percorsi assistenziali.